Στα πλαίσια των διδακτικών και ερευνητικών δραστηριοτήτων και αναγκών του Τμήματος, λειτουργούν τα παρακάτω εργαστήρια με πλούσιο εξοπλισμό και σημαντικό ερευνητικό έργο:
- Αναλυτικής Γεωχημείας, με υπεύθυνους καθηγητές τους Δρ. Χαραλαμπίδη Γεώργιο και Δρ. Ιορδανίδη Ανδρέα
- Ατμοσφαιρικής Ρύπανσης και Περιβαλλοντικής Φυσικής, με υπεύθυνο καθηγητή τον Δρ. Τριανταφύλλου Αθανάσιο
- Γεωμηχανικής & Γεωστατικής Μηχανικής, με υπεύθυνο καθηγητή τον Δρ. Σαχπάζη Κωνσταντίνο
- Εφαρμοσμένης Γεωφυσικής, με υπεύθυνη καθηγήτρια την Δρ. Ασβεστά Αργυρώ
- Μεταλλευτικής Πληροφορικής και Εφαρμογών Γεωγραφικών Συστημάτων Πληροφοριών, με υπεύθυνο καθηγητή τον Δρ. Καπαγερίδη Ιωάννη
- Μικροσκοπίας Ορυκτών και Πετρωμάτων, με υπεύθυνη καθηγήτρια την Δρ. Ασβεστά Αργυρώ
- Εργαστήριο Περιβαλλοντικής Μεταλλευτικής και Αποκατάστασης Διαταραγμένων Εδαφών, με υπεύθυνο καθηγητή τον Δρ. Βατάλη Κωνσταντίνο
- Προηγμένων Υλικών & Ηλεκτροχημικής Τεχνολογίας, με υπεύθυνο καθηγητή τον Δρ. Κυρατζή Νικόλαο